短い方がスリルがあるから

作者の趣味

流行廃り。

製作者の趣向

流行り

動きが見せやすいからだと思うのです

そっちの方が萌えるからとか？

それぞれ描く人の好み
もしくは恣意的に集めたデータのせい

それが事実なら、創作物に登場するJKが平均的な高校生のイメージから乖離して「JKは必ずミニスカートを履く」という定形(=送り手と読者との暗黙の了解)が成り立っているのかも知れない。
質問者が触れている創作ものに偏りがあるだけかも知れない。私が読んだマンガの女子高校生はあんまりミニスカート履いてるようには思えなかったから……偏ってるのは私のほうなのかな。

わからんちょ。